加班工资计算包括按月工资收入计算、按劳动合同约定计算两个方面。加班费是对劳动者超时工作的法定补偿，而赔偿金是对劳动者权益受损时的经济赔偿。两者虽然性质不同，但在特定情况下可能同时存在。

加班工资的计算涉及到劳动者的权益保障，具体计算方法有以下两种：

按月工资收入计算：

月工资收入除以月计薪天数（21.75天）得到日工资收入。如果劳动者在休息日加班，则按照日工资收入的200%支付加班工资；如果是在法定节假日加班，则按照300%支付加班工资。

按劳动合同约定计算：

如果劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，则按照约定进行计算。

加班费与赔偿金之间有的关系：

1. 加班费是对劳动者超时工作的补偿，而赔偿金则是在劳动者权益受到侵害时，由用人单位给予的经济赔偿。

2. 根据《劳动法》的规定，用人单位应当按照法律规定支付劳动者加班期间的加班费。这意味着，如果用人单位未按时支付加班费，劳动者可以要求支付并可能获得相应的赔偿。

3. 当劳动者的权益受到用人单位的侵害时，如未获得足额的加班费或其他违反劳动法的行为，劳动者可以要求赔偿金，赔偿金的目的是弥补劳动者因权益受损而产生的经济损失。

4. 在某些情况下，劳动者既可以根据法律规定要求支付加班费，也可以要求赔偿金。例如，用人单位未按照法律规定支付加班费，导致劳动者提出解除劳动合同的，除了支付拖欠的加班费外，用人单位还需要支付经济补偿金。