公司乱扣工资可以通过以下方法投诉： 1、到劳动行政部门举报，通常是公司所在地的劳动监察大队管理； 2、也可以直接向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付应发的工资；劳动者申请劳动争议仲裁，应自劳动争议发生之日起一年内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。仲裁委员会一般会在收到仲裁申请之日起60日内作出裁决。对仲裁裁决无异议的，当事人必须履行。如果当事人拒绝执行生效的仲裁裁决的，可以向人民法院申请强制执行。 3、劳动争议当事人对仲裁裁决不服的，可在收到仲裁裁决之日起15日内向人民法院起诉。一审法院适用民事程序审理劳动争议案件，一般在立案之日起6个月内结案；如果当事人不服一审判决，可在收到判决书之日起15日内提起上诉，二审法院审理期限一般为3个月。

法律依据：

中华人民共和国劳动合同法第六十条 劳务派遣单位应当将劳务派遣协议的内容告知被派遣劳动者。 劳务派遣单位不得克扣用工单位按照劳务派遣协议支付给被派遣劳动者的劳动报酬。 劳务派遣单位和用工单位不得向被派遣劳动者收取费用。