医疗行政处理的程序有：第一，申请。医疗事故争议当事人自知道或者应当知道，其身体健康受到损害之日起1年内，可以向医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门，提出医疗事故争议处理书面申请。第二，受理。县级人民政府卫生行政部门自收到医疗事故争议处理申请之日起10日内进行审查，作出是否受理的决定。第三，鉴定。卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。