虽然使用发票的单位和个人应当妥善保管发票，但是生活中，偶尔还是有公司会出现丢失发票的情况，出现这种情况不用太过焦虑，一般都是有补救的办法。当公司发生发票丢失的情形时，应当于丢失当天写一份《情况说明》，加盖公司公章后书面报告税务机关，并在《中国税务报》或其他媒体上登报声明发票作废. 根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，丢失发票后擅自损毁发票的，由税务机关责令改正，可以罚款1万元以下；情节严重的，罚款1万元以上3万元以下；有违法所得予以没收。 因此，如不及时报告税务机关，公司可能需要交纳两笔税款并承担虚开发票的风险，情节严重，还可能面临罚款。

法律依据：

《中华人民共和国发票管理办法》第三十六条跨规定的使用区域携带、邮寄、运输空白发票，以及携带、邮寄或者运输空白发票出入境的，由税务机关责令改正，可以处１万元以下的罚款；情节严重的，处１万元以上３万元以下的罚款；有违法所得的予以没收。丢失发票或者擅自损毁发票的，依照前款规定处罚。