最新技术合同认定程序是：申请、受理、审查认定、办理登记、核定技术性收入，核定的技术交易额要在技术合同中单独载明。技术开发合同或者技术转让合同包含技术咨询、技术服务内容的，技术咨询、技术服务所得的报酬，可以计入技术交易额。

　　为什么要进行技术合同认定登记

　　经认定登记的技术合同，当事人可以依照有关规定享受国家有关促进科技成果转化的税收信贷和奖励等方面的优惠政策，而未申请认定登记和未予登记的合同不得享受有关优惠政策。优惠政策主要包括：企业支付的技术价款、报酬、使用费或者佣金可以按照国家有关规定摊入成本；对从事技术转让，技术开发业务和与之相关的技术咨询，技术服务取得的收入，免征营业税和所得税等。

　　法律依据

　　《技术合同认定规则》第二十九条，申请认定登记的技术合同，其标的涉及专利申请权、专利权、植物新品种权、集成电路布图设计权的，当事人应当提交相应的知识产权权利证书复印件。无相应证书复印件或者在有关知识产权终止、被宣告无效后申请认定登记的，不予登记。申请认定登记的技术合同，其标的涉及计算机软件著作权的，可以提示当事人提供计算机软件著作权登记证明的复印件。

　　第三十一条，申请认定登记的技术合同，其合同标的为进入公有领域的知识、技术、经验和信息等（如专利权或有关知识产权已经终止的技术成果），或者技术秘密转让未约定使用权、转让权归属的，不应认定为技术转让合同。