订立著作权许可使用合同的方式为：双方协商订立。著作权转让书面合同应包括以下内容：许可使用的权利种类；许可使用的权利是专有使用权或者非专有使用权；许可使用的地域范围、期间；付酬标准和办法；违约责任；双方认为需要约定的其他内容。

　　出版合同纠纷通常的处理方式有：

　　（1）双方协商。通过对法律和合同的解释，来达到互谅互让，达成和解。

　　（2）通过行业协会的调解职能，申请第三方调解。

　　（3）向人民法院起诉（或有仲裁条款时申请仲裁），在仲裁和诉讼过程中，双方也可以就争议进行调解，调解不成，仲裁机构或法院会做出裁判。

　　法律依据

　　《民法通则》

　　第九十四条著作权

　　公民、法人享有著作权(版权)，依法有署名、发表、出版、获得报酬等权利。

　　《中华人民共和国专利法》

　　第六条执行本单位的任务或者主要是利用本单位的物质技术条件所完成的发明创造为职务发明创造。职务发明创造申请专利的权利属于该单位；申请被批准后，该单位为专利权人。