加班工资公司要交税。加班费计入员工工资总额，合并计算个人所得税。个人取得的所得，只要是与任职、受雇有关，不管其单位的资金开支渠道或以现金、实物、有价证券。其中，工资包括一般工资和加班工资，以及提成等等。

　　个人所得税是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。

　　加班工资也是需要计入到工资收入里面的，依照法律的规定缴纳个人所得税。所以我们也要对个税的征收有一定的了解，目前征收的起点为5000元，对于每个劳动者都要知道具体的征收交税规定。

　　法律依据

　　根据《关于工资总额组成的规定》（1989年9月30日国务院批准1990年1月1日国家统计局令第1号发布）的规定，工资总额由下列六个部分组成：计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资。