员工离职时的加班工资核算基数的计算是按照合同当中所约定的具体的工资，如果说没有约定的话，那么应当按照实际进行发放的工资来进行计算，并且在我国，劳动合同法当中规定了在离职之前的12个月的平均工资作为计算的依据。

　　员工加班费计算基数如何确定

　　1、工作日安排劳动者延长工作时间的，单位应支付不低于工资的150%的工资报酬;休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，单位应支付不低于工资的200%的工资报酬。

　　2、对于计算的基数，实行计时工资的用人单位，指的是用人单位规定的其本人的基本工资，其计算方法是：用月基本工资除以月法定工作天数即得日工资，用日工资除以日工作时间即得小时工资。实行计件工资的用人单位，指的是劳动者在加班加点的工作时间内应得的计件工资。

　　法律依据

　　《劳动法》第四十四条规定：有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

　　（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。

　　（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。

　　（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。